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磺化Cy5是Cy5的水溶型。它的光谱性质和Cy5类似，在荧光显微镜下发远红色荧光。它荧光亮，对pH不敏感，一般可以用633nm或647nm的激光束激发然后用Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。磺化Cy5荧光落在远红光区，使用磺化Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。磺化Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子等。

磺化Cy5水溶性非常好，可在水相标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外由于强水溶性加染料分子本身带电荷，磺化Cy5标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。

叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4℃)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。

磺化Cy5标记后的产物Ex/Em是649/672nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 647，DyLight 649，ATTO 647等。

CAS号	1481447-40-8
分子式	C35H43N6KO7S2
分子量	762.98
结构式
光谱特性	Ex/Em＝649/672nm (PBS缓冲液)
消光系数	271000L·mol-1·cm-1
量子产率	0.28
外观	深蓝色固体
溶解性	易溶于甲醇，DMF等有机溶剂，极易溶于水
保存条件	避光，干燥，-20℃保存

• 磺化Cy5水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy5-叠氮。
  
• 叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
  
• 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊。